本站成立於民國56年10月1日，設址：馬公市中華路72號，初期係租用民宅規劃為辦公廳，機車考驗場則設在辦公廳後面空地，汽車檢驗場暫用鄰近公地，因業務量不大，尚可容納。惟隨業務量逐漸擴增，服務民眾項目增加，致原有設備場地無法接納，遂於65年規劃擴建新站於現址，並於68年6月1日啟用。新辦公廳係鋼筋結構三層大樓，美侖美奐闢建有汽、機車考驗場，汽車考驗場及各項業務作業窗口，其總面積約二萬平方公尺，設備完善，足以承辦各項公路監理業務。

87年6月為簡化作業流程，提高行政效率，縮短民眾候件時間，以規畫駕駛人、車籍管理、違章裁罰等單一窗口作業，使「為民服務」工作更落實。並以迅速、簡便、正確為導向的服務，追求「有效率」、「有創意」、「有活力」的新形象。

監理業務與民眾息息相關，因此，一切作為應「以民為尊」「以民為導向」，全體同仁，更應本著推己及人的服務精神，繼續推展本站監理業務，迎接21世紀新的挑戰。